PCR儀根據DNA擴增的目的和檢測的標準可以分普通PCR儀、梯度PCR儀、原位PCR以及實時熒光定量PCR儀等幾類。
一般把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀，稱之為普通PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運行。主要是用作簡單的，對目的基因退火溫度的擴增。主要應用于科研、教學、臨床醫學、檢驗、檢疫等。
PCR儀的PCR反應過程與細胞內的DNA復制相似，但PCR的反應體系要簡單的多，主要包括DNA靶序列、引物、4種單核苷酸dNTP、耐熱DNA聚合酶以及合適的緩沖液體系。
PCR反應過程有以下3個步驟：
1.變性
將反應體系混合物加熱到94℃，維持較短時間（大約15-30 s），使目標DNA雙螺旋的氫鍵斷裂，形成單鏈DNA作為反應模板。
2.退火
將反應體系冷卻至特定的溫度（引物的TM值左右或以下），引物與DNA模板的互補區結合，形成模板引物復合物。
3.延伸
將反應體系的溫度提高到72℃并維持一段時間，引物在耐熱聚合酶的作用下，以引物為固定起點，以4種單核苷酸（dNTP）作為底物合成新的DNA鏈。
以上三步驟作為一個循環重復的進行，每一循環的產物作為下一循環的模板。如此循環數十次，從而使目的基因得到指數級擴增，達到檢測或獲取基因的目的。
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